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利用简单重复序列分子标记分析我国侧耳栽培菌株的遗传多样性(英文)
引用本文:吴丹丹,张震,张瑞颖,胡丹丹,顾金刚,胡清秀,左雪梅.利用简单重复序列分子标记分析我国侧耳栽培菌株的遗传多样性(英文)[J].食用菌学报,2012(2):15-25.
作者姓名:吴丹丹  张震  张瑞颖  胡丹丹  顾金刚  胡清秀  左雪梅
作者单位:1. 安徽农业大学生命科学学院,安徽合肥230036;农业部农业微生物资源收集与保藏重点实验室,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所,北京100081
2. 安徽农业大学生命科学学院,安徽合肥,230036
3. 农业部农业微生物资源收集与保藏重点实验室,中国农业科学院农业资源与农业区划研究所,北京100081
4. 北京市科学技术研究院,北京,100089
基金项目:Sponsored by the Foundation of the National Natural Science Foundation of China(No.31101588)
摘    要:采用FIASCO方法,从糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)菌株ACCC 50838分离简单重复序列分子标记(Simple sequence repeat,SSR),所得标记用于分析我国52个侧耳(平菇)栽培菌株多样性,对于SSR标记相同的菌株再进行ISSR PCR分析。结果表明:18个SSR标记在供试菌株中的等位基因的数量为3~12个,多态性指数(PIC)为0.34~0.84;除了2组(ACCC50618,ACCC 50866和ACCC 50915;ACCC 50249和ACCC50476)共5个菌株之外,其他47个菌株都能利用这18个SSR标记进行有效的鉴别。SSR标记相同的的菌株,其ISSR、体细胞不亲合性和出菇性状(温型、菌盖颜色)也相同,这些菌株可能是同物异名。利用这18个SSR标记分析52个菌株的遗传多样性,相似性指数为0.755~0.9995。根据相似性指数进行聚类分析,52个菌株分成两个大的类群,分别为糙皮侧耳(P.ostreatus)和肺形侧耳(P.pulmonarius)。结合这些栽培菌株的农艺性状和SSR分子标记的聚类分析结果,我国平菇栽培菌株的遗传多样性非常丰富。研究表明SSR分子标记技术在平菇遗传多样性和菌株鉴别中具有广泛的应用前景。

关 键 词:简单重复序列  平菇类  糙皮侧耳  肺形侧耳  遗传多样性  鉴别

Characterization of 18 Novel Polymorphic SSR Markers and Evaluation of Genetic Diversity Within Oyster Mushroom Strains Cultivated in China
WU Dandan , ZHANG Zhen , ZHANG Ruiying , HU Dandan , GU Jingang , HU Qingxiu , ZUO Xuemei.Characterization of 18 Novel Polymorphic SSR Markers and Evaluation of Genetic Diversity Within Oyster Mushroom Strains Cultivated in China[J].Acta Edulis Fungi,2012(2):15-25.
Authors:WU Dandan  ZHANG Zhen  ZHANG Ruiying  HU Dandan  GU Jingang  HU Qingxiu  ZUO Xuemei
Institution:1School of Life Science,Anhui Agricultural University,Hefei,Anhui 230036,China;2Key Laboratoryof Microbial Resources Collection and Preservation,Ministry of Agriculture,Institute of AgriculturalResources and Regional Planning,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Beijing 100081,China;3Beijing Academy of Science and Technology,Beijing 100089,China
Abstract:
Keywords:Simple sequence repeat (SSR)  oyster mushroom  Pleurotus ostreatus  Pleurotus pulmonarius  genetic diversity  strain differentiation
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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