茶树CsLhcb4基因的电子克隆与生物信息学分析

采用电子克隆方法获得茶树CP29蛋白的c DNA序列(Cs Lhcb4),并进行相关生物信息学分析。结果表明,该基因包含1个858 bp的开放阅读框,编码285个氨基酸,分子量为31.1 ku,理论等电位点5.79。该基因为亲水蛋白,可能位于叶绿体上,属于叶绿素a/b连接蛋白超家族成员,其二级结构主要是α-螺旋和无规则卷曲,三级结构构建模型为单体形式。序列进化分析表明,茶树CsLhcb4基因编码蛋白与大豆、欧洲大叶杨和陆地棉进化距离最近。以上结果为进一步分析CsLhcb4的功能及花青素代谢中的作用奠定基础。