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桑树潜在致敏原鉴定与生物信息学分析
引用本文:刘潮,韩利红,宋培兵,张亚萍,唐利洲.桑树潜在致敏原鉴定与生物信息学分析[J].江苏农业科学,2018(11).
作者姓名:刘潮  韩利红  宋培兵  张亚萍  唐利洲
作者单位:曲靖师范学院云南高原生物资源保护与利用研究中心/云南省高校云贵高原动植物多样性及生态适应性进化重点实验室
摘    要:致敏原是能引发Ⅰ型过敏反应的抗原性物质,桑树的花粉和果实均能引起人的过敏反应。为了解桑树的潜在致敏原信息,以报道的致敏原为探针,搜索桑树蛋白数据库,获得桑树潜在致敏原信息,并对其家族分布、结构和功能进行分析。结果显示,共获得143条桑树的潜在致敏原蛋白,它们分属于71个不同的基因本体(gene ontology,简称GO)注释子条目和49个pfam家族,且其结构和功能各不相同。其中多个成员属于常见的致敏家族,如Bet v 1家族、Profilin家族、Thaumatin家族、Rlp A-like_DPBB家族,与已鉴定的致敏原具有较高的序列一致性和相似的三级结构。研究结果有助于过敏症的临床诊断和交叉反应的预警。

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