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基于比较基因组学的簸箕柳DNA模体预测
引用本文:徐逸卿,毕长伟,张福全,杜思源,蒋安纳,业宁.基于比较基因组学的簸箕柳DNA模体预测[J].北方园艺,2018(6):67-73.
作者姓名:徐逸卿  毕长伟  张福全  杜思源  蒋安纳  业宁
作者单位:南京林业大学信息科学技术学院,江苏南京210037;东南大学计算机科学与工程学院,江苏南京210018;东南大学计算机科学与工程学院,江苏南京,210018;南京林业大学信息科学技术学院,江苏南京,210037
基金项目:国家重点基础研究发展计划资助项目,国家重点研发计划资助项目
摘    要:以已完成全基因组测序及组装的模式生物拟南芥和具有很高研究价值的园艺植物柳树(Salix)的全基因组测序为数据源,采用基于位置的基因序列匹配方法,研究了新测序物种簸箕柳(Salix suchowensis)的DNA模体序列,以期为进一步了解柳树乃至林木的基因调控网络提供参考依据。结果表明:此次预测的结果与手工验证的部分簸箕柳的DNA模体一致,该研究发布的基于簸箕柳全基因组的DNA模体预测结果对于杨柳科植物的研究具有重要的意义。

关 键 词:簸箕柳  DNA模体  比较基因组学

DNA Motif Prediction of Shrub Willow Based on Comparative Genetics
XU Yiqing,BI Changwei,ZHANG Fuquan,DU Siyuan,JIANG Anna,YE Ning.DNA Motif Prediction of Shrub Willow Based on Comparative Genetics[J].Northern Horticulture,2018(6):67-73.
Authors:XU Yiqing  BI Changwei  ZHANG Fuquan  DU Siyuan  JIANG Anna  YE Ning
Abstract:
Keywords:
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