高温胁迫条件下大菱鲆肾脏转录组研究

为探索大菱鲆(Scophthalmus maximus)耐高温的分子机制，筛选耐高温相关基因，采用高通量测序平台(IlluminaHiSeq-2500)分别对5个不同高温处理组的大菱鲆肾脏组织开展转录组测序，进行生物信息学分析，包括GO(基因功能注释)、SSR(简单重复序列)分析等。结果显示，通过组装得到Unigenes总数目为68525，长度范围为201~23456 bp，平均长度为1124 bp，N50长度为2316 bp。将Unigenes分别在Nr、Swissprot、KEGG、KOG、GO数据库进行序列比对及功能注释，共注释25498条，其中，Nr数据库注释到的Unigenes最多；按GO功能分类，共分为细胞组分、分子功能及生物学过程3类，包括56个功能组，其中，大量Unigenes与细胞进程、代谢过程、催化活性、生物调节、应激反应相关。将Unigenes进行pathway注释，归属于218条代谢通路，分为5类KEGG途径：代谢途径、遗传信息处理、细胞过程、环境信息和生物系统。进行转录因子分析，共检测到65类转录因子，其中，C2H2锌指蛋白家族的基因数目最多。通过对不同温度胁迫下基因表达谱结果进行分析，不同温度组之间存在着显著差异，在不同温度胁迫组中，20℃组与28℃组存在差异最大，差异基因达到4734个，其中，上调基因3386个，下调基因1348个。本研究建立了大菱鲆热应激肾脏转录组数据库，为大菱鲆高温胁迫分子机理研究提供了参考数据。