东方蜜蜂微孢子虫RRDRP的分子特性及系统进化分析 |
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作者姓名: | 张凯遥 冯佩林 宓诗雨 郭思佳 张艺琼 荆欣 陈大福 郭睿 付中民 |
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作者单位: | 1. 福建农林大学蜂学与生物医药学院;2. 福建农林大学天然生物毒素国家地方联合工程实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(32172792);;国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-44-KXJ7);;福建省自然科学基金项目(2022J01131334、2023J01133656); |
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摘 要: | 【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Rad18-like重组与DNA修复蛋白(Rad18-like recombination and DNA repair protein, RRDRP)进行系统进化分析,为进一步研究其功能提供理论依据。【方法】利用Protparam、ProtScale和SWISS-model等软件分析RRDRP的理化性质、亲水性和三级结构。利用SignalP 4.1 Server、NetPhos 3.1 Server、TMHMM和SOPMA等软件预测RRDRP的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域及二级结构。使用PSORTⅡ软件预测RRDRP蛋白的亚细胞定位。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种RRDRP的保守基序。通过Mega 11.0软件对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RRDRP进行氨基酸序列多重比对,并采用邻接法构建系统进化树。【结果】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP基因含有2 928个核苷酸,可编码975个氨基酸,分子质量约11.50 ku,脂溶系数93.58,等电点6.63,分子式C5135H8253N
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关 键 词: | 东方蜜蜂微孢子虫 染色体结构维持蛋白 Rad18-like重组和DNA修复蛋白 分子特性 系统进化 |
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