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东方蜜蜂微孢子虫RRDRP的分子特性及系统进化分析
引用本文:张凯遥,冯佩林,宓诗雨,郭思佳,张艺琼,荆欣,陈大福,郭睿,付中民.东方蜜蜂微孢子虫RRDRP的分子特性及系统进化分析[J].福建农林大学学报(自然科学版),2024(3):371-376.
作者姓名:张凯遥  冯佩林  宓诗雨  郭思佳  张艺琼  荆欣  陈大福  郭睿  付中民
作者单位:1. 福建农林大学蜂学与生物医药学院;2. 福建农林大学天然生物毒素国家地方联合工程实验室
基金项目:国家自然科学基金项目(32172792);;国家现代农业产业技术体系建设专项资金项目(CARS-44-KXJ7);;福建省自然科学基金项目(2022J01131334、2023J01133656);
摘    要:【目的】通过对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的Rad18-like重组与DNA修复蛋白(Rad18-like recombination and DNA repair protein, RRDRP)进行系统进化分析,为进一步研究其功能提供理论依据。【方法】利用Protparam、ProtScale和SWISS-model等软件分析RRDRP的理化性质、亲水性和三级结构。利用SignalP 4.1 Server、NetPhos 3.1 Server、TMHMM和SOPMA等软件预测RRDRP的信号肽、磷酸化位点、跨膜结构域及二级结构。使用PSORTⅡ软件预测RRDRP蛋白的亚细胞定位。使用MEME软件预测东方蜜蜂微孢子虫和其他物种RRDRP的保守基序。通过Mega 11.0软件对东方蜜蜂微孢子虫和其他物种的RRDRP进行氨基酸序列多重比对,并采用邻接法构建系统进化树。【结果】东方蜜蜂微孢子虫RRDRP基因含有2 928个核苷酸,可编码975个氨基酸,分子质量约11.50 ku,脂溶系数93.58,等电点6.63,分子式C5135H8253N

关 键 词:东方蜜蜂微孢子虫  染色体结构维持蛋白  Rad18-like重组和DNA修复蛋白  分子特性  系统进化
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