大豆再生相关基因GmLEC的克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 武小霞,王敏,陈庆山,张超,李思楠,马彦龙,孙晶,刘明,姜成涛,李文滨,李沫,刘佳慧,王智,张希瑞,苏安玉.大豆再生相关基因GmLEC的克隆及生物信息学分析[J].东北农业大学学报,2015(4):1-9. |
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作者姓名: | 武小霞 王敏 陈庆山 张超 李思楠 马彦龙 孙晶 刘明 姜成涛 李文滨 李沫 刘佳慧 王智 张希瑞 苏安玉 |
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作者单位: | 东北农业大学农学院大豆生物学教育部重点实验室;东北农业大学资源与环境学院 |
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摘 要: | 利用同源克隆技术,对拟南芥再生相关基因LEC进行同源序列比对,从大豆中克隆LEC基因两个成员的全长CDS序列,得到大豆再生相关基因Gm LEC1-a,Gm LEC1-b及Gm LEC2-a,Gm LEC2-b,用生物信息学方法对大豆Gm LEC1及Gm LEC2基因核苷酸序列以及蛋白质结构、亲水性和疏水性及进化树等进行分析。结果表明,大豆再生相关基因Gm LEC1-a编码区长度为672 bp,编码223个氨基酸,Gm LEC1-b编码区长度为681 bp,编码226个氨基酸,Gm LEC2-a编码区长度为2 205 bp,编码734个氨基酸,Gm LEC2-b编码区长度为2 196 bp,编码731个氨基酸,Gm LEC蛋白为亲水性不稳定蛋白;通过对LEC蛋白功能结构域进行分析发现,Gm LEC1为H4超家族成员,Gm LEC2为B3超家族成员,并均与拟南芥属植物亲缘较近。
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关 键 词: | 大豆 再生 GmLEC 生物信息学 |
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