| 不同品种紫花苜蓿转录组分析及营养品质差异的探讨 |
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| 引用本文： | 成启明,格根图,撒多文,王志军,范文强,卜振鲲,司强,李俊峰,卢娟,贾玉山.不同品种紫花苜蓿转录组分析及营养品质差异的探讨[J].草业学报,2019,28(10):199-208. |
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| 作者姓名： | 成启明 格根图 撒多文 王志军 范文强 卜振鲲 司强 李俊峰 卢娟 贾玉山 |
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| 作者单位： | 内蒙古农业大学草原与资源环境学院,农业部饲草栽培、加工与高效利用重点试验室,草地资源教育部重点实验室,内蒙古 呼和浩特 010011;内蒙古自治区科技信息研究院,内蒙古 呼和浩特,010010;内蒙古自治区草原勘察规划院,内蒙古 呼和浩特,010051;内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古 呼和浩特,010031;四川省会东县农牧局,四川 凉山,615000 |
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| 基金项目： | 国家自然基金面上项目(31572461)和国家重点研发项目(2016YFC0501308-3)资助 |
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| 摘 要： | 为了丰富紫花苜蓿转录组数据信息,找出不同品种紫花苜蓿的差异基因及代谢通路。通过Illumina HiSeq 4000平台对准格尔和WL319HQ的苜蓿叶片的RNA文库进行de novo组装。得到了约39G总的核苷酸,2亿多个reads,组装得到66734个Unigenes,平均长度为869 bp。将所得到的Unigenes与NCBI nonredundant protein(Nr),A manually annotated and reviewed protein sequence database(Swissprot),Clusters of eukaryotic orthologous groups(KOG)和Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)数据库比对,分别获得44888(67.26%),29190(43.74%),24844(37.23%)和15647(23.45%)条序列的注释信息。在2个紫花苜蓿叶片中找到1098个差异表达基因 (DEGs) ,其中有706个上调,392个下调(准格尔-vs-WL319HQ)。对其差异基因做了Gene ontology(GO)功能分析和KEGG途径分析,初步分析了2个品种营养品质差异的内在原因。极大地丰富了紫花苜蓿转录组数据信息,为今后紫花苜蓿的转录组测序提供理论依据,同时为紫花苜蓿生产实践提供参考。
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| 关 键 词： | 紫花苜蓿 转录组测序 营养品质 denovo组装 差异基因 |
| 收稿时间： | 2018-10-30 |
| 修稿时间： | 2018-12-10 |
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