牦牛MDHⅠ基因多态性及其与生长性状的关联分析

本研究旨在探讨牦牛细胞质苹果酸脱氢酶（cytoplasmic malate dehydrogenase，MDHⅠ）基因的遗传多态性及其与生长性状的关联性，以期为牦牛优良性状选育提供参考依据。选取5个牦牛类群（共178头），采集耳组织样提取DNA并构建DNA池，对MDHⅠ基因所有外显子设计特异性引物进行扩增测序，用Mega 5.2筛查SNPs位点，直接测序法鉴定其基因型，利用PopGene 32进行χ²独立性检测、基因纯合度（Ho）、基因杂合度（He）、有效等位基因频率（Ne）和多态信息含量（PIC）分析，利用SPSS 24.0分析MDHⅠ基因与牦牛生长性状间的关联性。结果表明，申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均在外显子8区域发现1个突变位点（G23093C），属同义突变，有3种基因型：GC、CC和GG，5个牦牛类群中，GC基因型为优势基因型（类乌齐牦牛中GG为优势基因型），G为优势等位基因（斯布牦牛除外），在斯布牦牛中，G和C基因频率相等。χ²适应性检验表明，申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。MDHⅠ基因在申扎牦牛、帕里牦牛和斯布牦牛中属于高度多态（PIC>0.5），在麦洼牦牛和类乌齐牦牛中属于中度多态（0.25 < PIC < 0.5）；纯合度最高的是申扎牦牛和类乌齐牦牛。关联性分析结果表明，MDHⅠ基因不同基因型对类乌齐牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛体重有显著性影响（P<0.05）；且种间分析发现，MDHⅠ基因不同基因型对牦牛体重有显著性影响（P<0.05），说明该基因可作为人工选育的分子标记。