牦牛MDHⅠ基因多态性及其与生长性状的关联分析 |
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引用本文: | 陈露露,王会,柴志欣,钟金城,王吉坤,陈智华.牦牛MDHⅠ基因多态性及其与生长性状的关联分析[J].中国畜牧兽医,2019,46(9):2658-2664. |
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作者姓名: | 陈露露 王会 柴志欣 钟金城 王吉坤 陈智华 |
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作者单位: | 1. 西南民族大学, 青藏高原动物遗传资源保护与利用四川省、教育部重点实验室, 成都 610041;2. 西南民族大学, 青藏高原研究院, 成都 610041 |
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基金项目: | 西南民族大学硕士研究生创新课题重点项目(CX2018SZ102);国家肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37) |
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摘 要: | 本研究旨在探讨牦牛细胞质苹果酸脱氢酶(cytoplasmic malate dehydrogenase,MDHⅠ)基因的遗传多态性及其与生长性状的关联性,以期为牦牛优良性状选育提供参考依据。选取5个牦牛类群(共178头),采集耳组织样提取DNA并构建DNA池,对MDHⅠ基因所有外显子设计特异性引物进行扩增测序,用Mega 5.2筛查SNPs位点,直接测序法鉴定其基因型,利用PopGene 32进行χ2独立性检测、基因纯合度(Ho)、基因杂合度(He)、有效等位基因频率(Ne)和多态信息含量(PIC)分析,利用SPSS 24.0分析MDHⅠ基因与牦牛生长性状间的关联性。结果表明,申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均在外显子8区域发现1个突变位点(G23093C),属同义突变,有3种基因型:GC、CC和GG,5个牦牛类群中,GC基因型为优势基因型(类乌齐牦牛中GG为优势基因型),G为优势等位基因(斯布牦牛除外),在斯布牦牛中,G和C基因频率相等。χ2适应性检验表明,申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。MDHⅠ基因在申扎牦牛、帕里牦牛和斯布牦牛中属于高度多态(PIC>0.5),在麦洼牦牛和类乌齐牦牛中属于中度多态(0.25 < PIC < 0.5);纯合度最高的是申扎牦牛和类乌齐牦牛。关联性分析结果表明,MDHⅠ基因不同基因型对类乌齐牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛体重有显著性影响(P<0.05);且种间分析发现,MDHⅠ基因不同基因型对牦牛体重有显著性影响(P<0.05),说明该基因可作为人工选育的分子标记。
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关 键 词: | 牦牛 MDHⅠ基因 多态性 生长性状 关联分析 |
收稿时间: | 2018-12-29 |
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