基于线粒体Cytb序列的广东地区大刺鳅群体遗传多样性分析

为了解广东地区大刺鳅遗传多样性特征，采集广东地区6个水系（西江、北江、东江、鉴江、漠阳江、韩江）193尾大刺鳅样本，测定其线粒体Cytb序列，并利用MEGA 6.0软件碱基组特点和遗传距离、DNAsp 5.0软件分析各群体的多样性水平和Network 5软件绘制单倍型网络关系图。结果表明：大刺鳅Cytb序列长度1 138 bp，在193尾大刺鳅的Cytb序列中，A、C、T、G占比分别为25.9%、32.7%、27.7%和13.6%，遗传距离为0.000 2～0.013 1，遗传分化指数为0.035～0.866。6个大刺鳅群体共存在38个核苷酸变异位点，定义了20个单倍型，单倍型多样性为0.782，核苷酸多样性约为0.007 2。基于线粒体Cytb序列构建的NJ树显示，广东地区的大刺鳅种群分为Ⅰ和Ⅱ两支。其中，支系Ⅰ包含了西江、北江、鉴江和漠阳江群体的部分样本以及东江和韩江群体的全部样本；支系Ⅱ包含了西江、北江、鉴江和漠阳江群体的部分样本。单倍型网络分析显示，西江水系的群体与东江、韩江以及漠阳江群体的亲缘关系较近，而北江群体与东江、西江群体间遗传分化较大。AMOVA分析表明，77.09%...