| 玉米LEC1基因家族的鉴定与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘畅畅,黄敏.玉米LEC1基因家族的鉴定与生物信息学分析[J].甘肃农业科技,2022,53(1):31-37. |
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| 作者姓名： | 刘畅畅 黄敏 |
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| 作者单位： | 长江大学生命科学学院,湖北 荆州 434025 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金面上项目（31771801、32072069）； |
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| 摘 要： | LEC基因家族包含LEC1和LEC2,参与植物的生长发育及储藏物质的积累。LEC1（Leafy Cotyledon 1）是NF-YB9蛋白家族的成员,编码了CCAAT-box结合转录因子HAP3（Heme activated protein 3）亚单位。利用生物信息学方法,获得了16个玉米LEC1基因。分析发现,ZmLEC1蛋白大部分都是酸性的不稳定亲水蛋白,含有1个保守结构域CBFDNFYBHMF及10个保守基序。通过与拟南芥LEC1基因和水稻LEC1基因的聚类分析,将玉米LEC1基因家族分为4类:ClassⅠ、ClassⅡ、ClassⅢ、ClassⅣ。经RNA-seq等分析发现,玉米LEC1家族基因具有组织特异性,响应非生物胁迫。启动子分析发现,玉米LEC1基因启动子上含有响应激素和非生物胁迫的顺式作用元件。
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| 关 键 词： | 玉米 LEC1基因家族 生物信息学 |
| 收稿时间： | 2021/12/4 0:00:00 |
Identification and Bioinformatics Analysis of LEC1 Gene Family in Maize |
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| LIU Changchang,HUANG Min.Identification and Bioinformatics Analysis of LEC1 Gene Family in Maize[J].Gansu Agricultural Science and Technology,2022,53(1):31-37. |
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| Authors: | LIU Changchang HUANG Min |
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| Keywords: | |
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