金针菇基因组SSR位点分析及标记开发 |
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引用本文: | 金群力,沈颖越,蔡为明,周烁红,范丽军,冯伟林,宋婷婷,李良英,田芳芳.金针菇基因组SSR位点分析及标记开发[J].食用菌学报,2016(2):12-19. |
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作者姓名: | 金群力 沈颖越 蔡为明 周烁红 范丽军 冯伟林 宋婷婷 李良英 田芳芳 |
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作者单位: | 1. 浙江省农业科学院园艺研究所,浙江杭州,310021;2. 浙江师范大学化学与生命科学学院,浙江金华,321004 |
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基金项目: | 浙江省农业新品种选育重大科技专项-食用菌新品种选育(2012C12911),国家自然科学基金项目(31401930) |
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摘 要: | 以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选.统计结果表明,金针菇基因组有1279个位点,SSR位点密度为35.53/Mb,并以三核苷酸基序为主,重复数≥10的SSR(即高频)基序数目总计246个,占所有SSR位点的19.23%.设计的16对SSR标记均能扩增条带,多态率仅为18.75%.
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关 键 词: | 金针菇基因组 SSR位点 多态性标记 |
Distribution Pattern Analysis and Marker Development of SSR Loci in the Flammulina velutipes Genome |
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Abstract: | |
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Keywords: | Flammulina velutipes genome SSR loci polymorphism marker |
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