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金针菇基因组SSR位点分析及标记开发
引用本文:金群力,沈颖越,蔡为明,周烁红,范丽军,冯伟林,宋婷婷,李良英,田芳芳.金针菇基因组SSR位点分析及标记开发[J].食用菌学报,2016(2):12-19.
作者姓名:金群力  沈颖越  蔡为明  周烁红  范丽军  冯伟林  宋婷婷  李良英  田芳芳
作者单位:1. 浙江省农业科学院园艺研究所,浙江杭州,310021;2. 浙江师范大学化学与生命科学学院,浙江金华,321004
基金项目:浙江省农业新品种选育重大科技专项-食用菌新品种选育(2012C12911),国家自然科学基金项目(31401930)
摘    要:以金针菇(Flammulina velutipes)基因组序列为基础,对其SSR位点进行分析,设计16对引物对其中16个SSR位点进行标记设计,并对6个商业化的金针菇品种进行筛选.统计结果表明,金针菇基因组有1279个位点,SSR位点密度为35.53/Mb,并以三核苷酸基序为主,重复数≥10的SSR(即高频)基序数目总计246个,占所有SSR位点的19.23%.设计的16对SSR标记均能扩增条带,多态率仅为18.75%.

关 键 词:金针菇基因组  SSR位点  多态性标记

Distribution Pattern Analysis and Marker Development of SSR Loci in the Flammulina velutipes Genome
Abstract:
Keywords:Flammulina velutipes genome  SSR loci  polymorphism marker
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