| 西洋梨全基因组bZIP基因家族生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 孙耀国,蔡天润,姬行舟,张军. 西洋梨全基因组bZIP基因家族生物信息学分析[J]. 林业与生态科学, 2021, 36(1) |
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| 作者姓名： | 孙耀国 蔡天润 姬行舟 张军 |
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| 作者单位： | 河北农业大学林学院/河北省林木种质资源与森林保护重点实验室,河北保定071000;河北农业大学林学院/河北省林木种质资源与森林保护重点实验室,河北保定071000;河北农业大学林学院/河北省林木种质资源与森林保护重点实验室,河北保定071000;河北农业大学林学院/河北省林木种质资源与森林保护重点实验室,河北保定071000 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2016YFC0503106)。 |
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| 摘 要： | 碱性亮氨酸拉链(Basic leucine zipper,bZIP),是广泛存在于真核生物中的保守转录因子,其在植物生长过程中参与重要的调控作用。为了解西洋梨bZIP基因家族相关信息,本研究利用生物信息学的方法,在全基因组水平鉴定并分析了西洋梨bZIP基因家族。结果表明,共鉴定出52个PcbZIP基因,系统进化将其分为9个亚族(A、B、C、E、F、G、H、I和S),PcbZIPs中外显子的个数从1~10个不等,PcbZIP转录因子的氨基酸数目在122~741个,等电点在5.42~10.41,PcbZIP基因都定位在细胞核上。基因定位显示,52个PcbZIP基因不均匀地分布在17条染色体上。本研究对西洋梨bZIP家族基因的鉴定与分析,为进一步开展西洋梨bZIP基因的挖掘与功能验证提供依据。
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| 关 键 词： | 西洋梨 bZIP转录因子 基因家族 生物信息学 |
Genome-wide bioinformatics analysis of bZIP gene family in Pyrus communis |
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| SUN Yaoguo,CAI Tianrun,JI Xingzhou,ZHANG Jun. Genome-wide bioinformatics analysis of bZIP gene family in Pyrus communis[J]. Forestry and Ecological Sciences, 2021, 36(1) |
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| Authors: | SUN Yaoguo CAI Tianrun JI Xingzhou ZHANG Jun |
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| Affiliation: | (Hebei Key Laboratory for Tree Genetic Resources and Forest Protection/College of Forestry Science,Hebei Agricultural University,Baoding 071000,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Pyrus communis bZIP trancription factors gene family bininformatics |
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