铁皮石斛纤维素合成酶超级基因家族生物信息学分析 |
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引用本文: | 兰晓天,胡淞,冯磊,田英男,和凤美.铁皮石斛纤维素合成酶超级基因家族生物信息学分析[J].河南农业科学,2019,48(8). |
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作者姓名: | 兰晓天 胡淞 冯磊 田英男 和凤美 |
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作者单位: | 云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,650601;云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,650601;云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,650601;云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,650601;云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明,650601 |
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摘 要: | 纤维素合成酶超级基因家族是植物体纤维素合成的重要基因。为研究铁皮石斛纤维素合成酶和类纤维素合成酶基因(CESA/CSL)家族的功能,利用从铁皮石斛转录组中鉴定出的32个在茎中高表达量的纤维素合成酶超级基因家族成员为研究对象,使用MEGA 5.0、GSDS、SMART、TMHMM、WoLF PSORT等软件对其构建系统进化树,并对基因结构及蛋白质保守结构域、跨膜结构和亚细胞定位等进行综合分析。结果显示,CESA/CSL基因在铁皮石斛不同组织中表达的数目和表达量均不同,具有组织表达特异性。铁皮石斛茎中表达量较高的CESA/CSL基因家族可分为6个亚族,外显子数目1~21个。CESA/CSL基因编码的蛋白质保守性较强,除CSLA亚族外,其余亚族均含有该基因家族的保守结构域Cellulose synthase。CESA/CSL蛋白主要分布于质膜上,大部分具有跨膜结构域。
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关 键 词: | 铁皮石斛 纤维素合成酶超级基因家族 生物信息学 基因表达 |
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