棉花SBP家族基因的鉴定与分析 |
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作者姓名: | 郑玲 张欢欢 张延召 |
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作者单位: | 洛阳师范学院 生命科学学院,河南 洛阳,471000;洛阳师范学院 生命科学学院,河南 洛阳,471000;洛阳师范学院 生命科学学院,河南 洛阳,471000 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;河南省科技攻关计划 |
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摘 要: | 为研究棉花Squamosa启动子结合蛋白(SBP)家族成员的结构和功能,利用生物信息学方法,从棉花全基因组数据库中筛选并鉴定出83个棉花SBP家族成员,命名为GhSBP1—GhSBP83。并对该家族成员的蛋白质理化性质、多序列比对、系统进化树、基因染色体分布、基因结构、基因表达模式进行了全面分析。结果表明,棉花SBP转录因子家族可以分为8个亚族。棉花SBP基因分布在1—8号染色体以及11—13号染色体上。对NCBI中陆地棉的EST数据库进行比对分析,结果显示,40个棉花SBP转录因子家族成员在棉花的分生组织、茎、花、花芽、花药以及棉纤维中广泛表达。其中,GhSBP2、GhSBP4、GhSBP6等20多个基因在花药和棉纤维中均有表达,推测花药和棉纤维的生长发育可能同时受这些基因的控制。
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关 键 词: | 棉花 SBP家族基因 生物信息学 基因结构 功能分析 |
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