| 干旱胁迫下野生大豆ABC转运蛋白转录组测序分析 |
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| 引用本文： | 张小芳,乔亚科,王冰冰,徐燕,张锴,李桂兰. 干旱胁迫下野生大豆ABC转运蛋白转录组测序分析[J]. 核农学报, 2019, 33(8): 1474-1482. DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2019.08.1474 |
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| 作者姓名： | 张小芳 乔亚科 王冰冰 徐燕 张锴 李桂兰 |
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| 作者单位： | 河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北秦皇岛,066600;河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北秦皇岛,066600;河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北秦皇岛,066600;河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北秦皇岛,066600;河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北秦皇岛,066600;河北科技师范学院农学与生物科技学院,河北秦皇岛,066600 |
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| 基金项目： | 河北省自然科学基金项目(C2016407100),河北省研究生创新资助项目(CXZZSS2018148),现代农业产业技术体系河北省创新团队建设项目(HBCT2018090203) |
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| 摘 要： | 为获取干旱胁迫状态下ABC转运蛋白家族相关基因,以抗旱性强的野生大豆为试验材料,浇灌20%PEG 6000模拟干旱胁迫,分别在干旱处理0、 6、12、24和48 h后取叶片提取RNA进行转录组测序;以GO、KEGG和NR三大数据库注释的结果为基础,再以ABC转运蛋白为关键词进行筛选。结果表明,共获得337条ABC转运蛋白相关序列,包括8大亚家族(ABCA、ABCB、ABCC、ABCD、ABCE、ABCF、ABCG和ABCI)。差异表达分析结果表明,共有182条表现差异表达。GO注释到的差异表达基因多数为嘌呤核苷酸分解过程,KEGG注释到的差异表达基因分布在5个亚家族(ABCA、ABCB、ABCC、ABCD和ABCG)。对NR数据库有注释的168条差异表达基因进行进化分析,结果表明ABCE、ABCF、ABCG家族与ABCI11为一类,ABCB、ABCC家族与ABCI10为一类,ABCA、ABCD家族与ABCI19为一类。本研究为进一步研究野生大豆干旱胁迫下ABC转运蛋白抗旱基因提供了一定的理论依据。
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| 关 键 词： | 野生大豆 转录组测序 干旱胁迫 ABC转运蛋白 |
| 收稿时间： | 2018-06-26 |
Sequence Analysis of ABC Transporter Transcriptome in Wild Soybean Under the Drought Stress |
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| ZHANG Xiaofang,QIAO Yake,WANG Bingbing,XU Yan,ZHANG Kai,LI Guilan. Sequence Analysis of ABC Transporter Transcriptome in Wild Soybean Under the Drought Stress[J]. Acta Agriculturae Nucleatae Sinica, 2019, 33(8): 1474-1482. DOI: 10.11869/j.issn.100-8551.2019.08.1474 |
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| Authors: | ZHANG Xiaofang QIAO Yake WANG Bingbing XU Yan ZHANG Kai LI Guilan |
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| Affiliation: | College of Agronomy and Biotechnology, Hebei Normal University of Science and Technology, Qinhuangdaoi, Hebei 066600 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | wild soybean RNA-seq drought stress ABC transporter |
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