猪抗酶1基因核心启动子区鉴定及单倍型转录活性比较 |
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引用本文: | 张爱玲,孙显月,张哲,李加琪,张豪. 猪抗酶1基因核心启动子区鉴定及单倍型转录活性比较[J]. 华中农业大学学报, 2016, 35(3): 94-100 |
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作者姓名: | 张爱玲 孙显月 张哲 李加琪 张豪 |
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作者单位: | 1. 广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室/华南农业大学动物科学学院,广州510642;广东第二师范学院生物与食品工程学院,广州510303;2. 广东省农业动物基因组学与分子育种重点实验室/华南农业大学动物科学学院,广州,510642 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31201771); 现代农业产业技术体系专项(CARS-36) |
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摘 要: | 通过双荧光素酶报告基因载体系统检测猪抗酶1(AZ1)基因启动子转录活性,分析蓝塘和长白猪群体AZ1基因启动子SNP及单倍型,在此基础上比较不同单倍型转录活性。结果表明:-453/+79为核心启动子区;在2个群体中检测到AZ1基因启动子8个SNPs,分别为-713 TC、-584 AC、-476 GA、-365 TC、-348 CT、-294 GC、-288 TG和-234 TC,蓝塘猪群体具有更丰富的单核苷酸多态性,而长白猪群体仅在-288座位存在GG和GT 2种基因型,其他7个SNPs均为纯合状态;蓝塘猪群体LTH1单倍型(TAGCCGTC,-713/-234)频率为0.526,为蓝塘猪优势单倍型,其次为LTH2(TAGCCGTT),频率为0.166;长白猪群体优势单倍型为Landrace-H(TAGTCGGT),频率为0.939。LTH1转录活性高于LTH2和Landrace-H,推测-234 TC、-365 TC和-288 TG座位是造成不同单倍型转录活性差异的原因。
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关 键 词: | 猪 抗酶(AZ1)基因 启动子 SNP 单倍型 |
收稿时间: | 2015-08-30 |
Identification of core promoter of porcine AZ1 gene and transcriptional activity of haplotypes |
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Abstract: | |
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Keywords: | pig AZ1(antizyme 1) gene promoter SNP haplotype |
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