| 杜仲幼果和叶片MVA途径基因表达差异分析 |
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| 引用本文： | 王 淋,乌云塔娜,叶生晶.杜仲幼果和叶片MVA途径基因表达差异分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2016,44(5):97-104. |
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| 作者姓名： | 王 淋 乌云塔娜 叶生晶 |
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| 作者单位： | 中国林业科学研究院 经济林研究开发中心；国家林业局杜仲工程技术研究中心,中国林业科学研究院 经济林研究开发中心；国家林业局杜仲工程技术研究中心,国家林业局 中南林业调查规划设计院 |
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| 基金项目： | 国家林业公益性行业科研专项（201004029） |
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| 摘 要： | 【目的】杜仲橡胶是一种多萜类物质,而甲羟戊酸(MVA)途径是合成萜类物质的重要途径之一。分析杜仲MVA途径相关基因表达的差异,预测杜仲橡胶合成的主要上游途径。【方法】在杜仲幼果和叶片转录组测序的基础上,根据基因功能注释和表达分析,确定MVA途径的系列基因,并对其进行表达差异分析。【结果】杜仲橡胶合成的MVA途径共涉及23条Unigene,分别为3条EuACOT、3条EuHMGS、8条EuHMGR、2条EuMK、1条EuPMK和6条EuMDP基因。根据转录组RPKM(Reads Per Kilo bases per Million reads)数据对基因表达差异进行分析,结果表明杜仲MVA途径中的EuACOT8、EuACOT10、EuHMGS4、EuHMGS5、EuHMGS6、EuHMGR18、EuMK3、EuMK4、EuMDP7、EuMDP8、EuMDP9、EuMDP10、EuMDP11基因在幼果和叶片中的表达量具有显著差异,其中仅EuMDP9在叶片中的表达量大于幼果,而其余基因在幼果的表达量大于叶片;EuHMGR15和EuHMGR17只在幼果中特异表达。【结论】MVA途径绝大部分基因在果实中大量表达,这与果实中杜仲橡胶含量远超过叶片的现象相吻合,推测杜仲果实MVA途径为杜仲橡胶合成的主要途径。
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| 关 键 词： | 杜仲 幼果和叶片 甲羟酸途径 基因表达差异 |
| 收稿时间： | 2014/9/29 0:00:00 |
Differential expression of MVA pathway genes in young fruits and leaves of Eucommia ulmoides Oliver |
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| WANG Lin,WUYUN Tana and YE Shengjing.Differential expression of MVA pathway genes in young fruits and leaves of Eucommia ulmoides Oliver[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2016,44(5):97-104. |
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| Authors: | WANG Lin WUYUN Tana and YE Shengjing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Eucommia ulmoides Olives young fruits and leaves MVA pathway differential expression of gene |
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