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湖北地区猪流行性腹泻病毒流行病学调查及N基因的序列分析
作者姓名:王妍  赵润泽  谭旭  张子微  李桐  李春琪  郭利伟  杨小林  刘国平
作者单位:长江大学
基金项目:国家自然科学基金(31602099);
摘    要:为了解湖北地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征及变异情况。2021年3月-2022年2月,从湖北地区共收集腹泻症状的粪便-肛门棉拭子1580份,采用双重巢式PCR法进行检测,分析不同养殖阶段、季节间的感染差异;并选取部分阳性样品进行PEDV-N基因的扩增与遗传进化分析。1580份样品共检出阳性样品318份,阳性率为20.13%(318/1580)。其中0~28 d仔猪、28~70 d保育猪、70~120 d后备猪、120~270 d中大猪和>270 d猪只的阳性率分别为40.27%、26.89%、10.33%、8.07%和5.50%。冬季为PEDV感染的高发期(36.66%),其次是春季(19.00%)和秋季(11.49%),夏季(5.55%)的检出率相对较低。将部分阳性样品进行PEDV-N基因测序,随机挑选12株测序序列与24株参考株进行遗传进化分析,测序序列间N基因的核苷酸同源性为94.0%~99.7%,氨基酸同源性为93.9%~100.0%;测序序列与参考毒株的核苷酸同源性为94.5%~99.8%,氨基酸同源性为94.6%~100.0%。通过系统性发育进化树分析,PE...

关 键 词:猪流行性腹泻病毒  流行病学  序列分析
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