| 民猪FoxN1基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李苓,张冬杰,汪亮,王鑫鑫,曹越,刘娣.民猪FoxN1基因的克隆及生物信息学分析[J].中国畜牧兽医,2016,43(4):928-933. |
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| 作者姓名： | 李苓 张冬杰 汪亮 王鑫鑫 曹越 刘娣 |
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| 作者单位： | 1. 东北农业大学动物科技学院, 哈尔滨 150030;2. 黑龙江省农业科学院畜牧研究所, 哈尔滨 150086 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31301955);黑龙江省自然科学基金项目(C201312);国家生猪产业体系岗位科学家(CARS-36) |
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| 摘 要： | 试验旨在对民猪FoxN1基因的结构和功能进行初步探索。利用常规PCR技术对民猪FoxN1基因进行克隆,利用生物信息学手段对所获得FoxN1基因完整编码区序列进行分析,对民猪和大白猪的FoxN1基因序列进行比对,并构建分子进化树。结果显示,民猪FoxN1基因完整编码区长1 941 bp,编码646个氨基酸,分子质量为68.64 ku,理论等电点为5.81。FoxN1蛋白位于细胞核内,不存在信号肽,不是分泌性蛋白,不存在跨膜区,在第269-347氨基酸处有1个叉头结构域,该蛋白在不同的物种间有高度的保守性。克隆发现了3种转录剪切变异体,与变异体1相比,变异体2在第124-387核苷酸位置处发生缺失,变异体3在581-582处发生GCA插入。民猪与大白猪的FoxN1基因序列相比,存在4个突变位点,其中3个是同义突变,1个是错义突变,导致第108位的氨基酸发生了改变。由分子进化树得知,民猪与偶蹄目动物亲缘关系较近。上述结果表明FoxN1基因结构复杂,对其生物信息特性的探究将为进一步揭示民猪FoxN1基因的功能提供依据。
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| 关 键 词： | 民猪 FoxN1基因 基因克隆 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2015-10-19 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of FoxN1 Gene of Min Pig |
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| LI Ling,ZHANG Dong-jie,WANG Liang,WANG Xin-xin,CAO Yue,LIU Di.Cloning and Bioinformatics Analysis of FoxN1 Gene of Min Pig[J].China Animal Husbandry & Veterinary Medicine,2016,43(4):928-933. |
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| Authors: | LI Ling ZHANG Dong-jie WANG Liang WANG Xin-xin CAO Yue LIU Di |
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| Institution: | 1. College of Animal Science and Technology, Northeast Agricultural University, Harbin 150030, China;2. Institute of Animal Husbandry, Heilongjiang Academy of Agricultural Sciences, Harbin 150086, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Min pig FoxN1 gene gene cloing bioinformatics analysis |
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