| 黄鳝肠道cDNA文库构建及营养相关表达序列标签分析 |
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| 引用本文： | 唐勇,刘旭,周定刚. 黄鳝肠道cDNA文库构建及营养相关表达序列标签分析[J]. 动物营养学报, 2010, 22(4). DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2010.04.027 |
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| 作者姓名： | 唐勇 刘旭 周定刚 |
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| 作者单位： | 四川农业大学动物科技学院,雅安,625014;四川农业大学动物科技学院,雅安,625014;四川农业大学动物科技学院,雅安,625014 |
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| 基金项目： | 四川省育种工程专项基金--长江上游名优经济鱼类的人工繁育项目 |
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| 摘 要： | 本研究旨在构建黄鳝肠道未剪切cDNA文库,对黄鳝肠道营养相关基因表达进行初步分析.以黄鳝全肠为试验材料,采用Invitrogen公司的Gateway技术构建了黄鳝肠道未剪切cDNA文库,并进行规模表达序列标签(expressed sequence tag,EST)测序和分析.结果表明:文库的库容量为1.46×107CFU,重组率达96.88%,平均插入片段长度2.11kb.随机挑取1056个cDNA阳性克隆进行测序,共获得906条有效的EST,其中886条的长度大于400bp,拼接组装得到762个单基因簇(unigene),包括61个重叠群(contig),701个单拷贝EST(singleton);与营养相关的EST共有5类59种,其中:蛋白质/氨基酸代谢类25种,碳水化合物代谢类13种,脂类代谢类5种,能量代谢类12种,无机离子代谢类4种.本文成功构建了黄鳝肠道未剪切cDNA文库,并进行了EST序列测定和分析,筛选出营养相关EST,为后续研究提供了基础数据.
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| 关 键 词： | 黄鳝 肠道 cDNA文库 表达序列标签 营养 |
Intestine cDNA Library Construction and Nutrition-related Expressed Sequence Tag Analysis of Monopterus albus |
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| TANG Yong,LIU Xu,ZHOU Dinggang. Intestine cDNA Library Construction and Nutrition-related Expressed Sequence Tag Analysis of Monopterus albus[J]. CHINESE JOURNAL OF ANIMAL NUTRITION, 2010, 22(4). DOI: 10.3969/j.issn.1006-267x.2010.04.027 |
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| Authors: | TANG Yong LIU Xu ZHOU Dinggang |
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| Affiliation: | TANG Yong LIU Xu ZHOU Dinggang(College of Animal Science and Technology,Sichuan Agricultural University,Ya'an 625014,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Monopterus albus intestinal tract cDNA library expressed sequence tag nutrition |
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