三角鲤线粒体基因组全序列测定及分析 |
| |
引用本文: | 李强,李文俊,韩崇,鲁同富,龚剑,桂林.三角鲤线粒体基因组全序列测定及分析[J].安徽农业科学,2024(5):108-111+120. |
| |
作者姓名: | 李强 李文俊 韩崇 鲁同富 龚剑 桂林 |
| |
作者单位: | 1. 广州大学生命科学学院;2. 广州大学环境科学与工程学院 |
| |
基金项目: | 广州市科技计划项目(201804010486);;广东省教育科学规划课题(2021GXJK097); |
| |
摘 要: | 目的]三角鲤(Cyprinus multitaeniata)是我国具有重要经济价值的鱼类之一,了解三角鲤线粒体基因的结构和特点,为三角鲤的种群遗传多样性研究提供基础资料。方法]采用26对引物扩增三角鲤的线粒体全基因,通过生物软件识别和分析各基因和非编码序列的位置和特点,并通过与GeneBank数据库已发表鲤科鱼类序列进行比较和构建系统发育树进行分析。结果]三角鲤线粒体全基因总长度为16 573 bp,碱基含量A为32.2%、T为24.9%、C为27.3%、G为15.6%;包括37个编码基因(编码蛋白基因13个、tRNA基因22个和rRNA基因2个)和2个非编码序列区(OL区和控制区)。13个蛋白编码基因中,COX1的起始密码子为GTG,其他均为ATG;终止密码子包括TAG(ATP8)、TA(COX3、ATP6)、T(ND2、COX2、ND3、ND4、Cty b)和TAA(ND1、COX1、ND4L、ND5、ND6)3种。22个tRNA基因中,除了tRNASer(AGC)外其余都能折叠成典型的三叶草结构;三角鲤控制区序列可以识别出3个典型...
|
关 键 词: | 三角鲤 线粒体基因组 全序列分析 系统发育 |
|
|