灰树花己糖转运蛋白的生物信息学分析

以灰树花转录组数据为参考，筛选到己糖转运蛋白（GfHXT2）的c DNA序列，利用生物信息学方法对GfHXT2蛋白的理化性质、亲/疏水性、信号肽、亚细胞定位分析、跨膜螺旋结构、保守结构域、二级结构、三级结构、蛋白修饰位点和蛋白交互网络等方面进行预测和分析。结果表明：GfHXT2基因cDNA总长1 871 bp,CDS共编码380个氨基酸。综合分析GfHXT2基因蛋白质亲水和疏水的得分和理化性质分析结果，判定其为较稳定的亲水蛋白，不含信号肽，亚细胞定位分析结果表明其在内质网的概率为55.6%，跨膜螺旋结构数量为10个。GfHXT2蛋白的二级结构存在4种状态，分别为α螺旋、无规则卷曲、延伸链和β转角。存在4个N端糖基化位点、3个O端糖基化位点。GfHXT2蛋白与13个蛋白质互作，即共同参与某一功能。