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山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究
引用本文:王德凤,杨永强,韩勇. 山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究[J]. 中国畜牧兽医, 2013, 0(7): 127-132
作者姓名:王德凤  杨永强  韩勇
作者单位:1. 贵州省畜牧兽医研究所, 贵州贵阳 550005;2. 贵州大学动物科学学院, 高原山地动物遗传育种 与繁殖教育部重点实验室, 贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室, 贵州贵阳 550025
基金项目:贵州省科学技术基金项目"AMPD1基因与小香羊肉质风味的关联研究"(黔科合J字[2011]2225号);贵州省畜禽健康养殖技术创新能力建设项目(黔科合院所创能[2010]4004号);留学回国人员科研启动项目《贵州小香羊优质肉质风味关键影响因子研究》。
摘    要:为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AMPD1基因启动子区存在5个SNPs位点,分别为:T-614A、G-326A、G-309A、T-287C和T-165C。生物信息学软件预测得到AMPD1基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNPs位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生7个新的转录因子结合位点。AMPD1基因RNA二级结构在突变后显著改变,但未检测到CpG岛区域。

关 键 词:腺苷单磷酸脱氨酶1  单核苷酸多态性  启动子  小香羊  黔北麻羊  努比山羊  
收稿时间:2012-11-30

Study on the SNPs of AMPD1 Gene Promoter Region in Goat
WANG De-feng,YANG Yong-qiang,HAN Yong. Study on the SNPs of AMPD1 Gene Promoter Region in Goat[J]. China Animal Husbandry & Veterinary Medicine, 2013, 0(7): 127-132
Authors:WANG De-feng  YANG Yong-qiang  HAN Yong
Affiliation:1. Guizhou Animal Husbandry and Veterinary Medicine Institute, Guiyang 550005, China;2. Guizhou Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction, Key Laboratory of Animal Genetics, Breeding and Reproduction in the Plateau Mountainous Region, Ministry of Education, College of Animal Sciences, Guizhou University, Guiyang 550025, China
Abstract:
Keywords:AMPD1  SNP  promoter  Small-xiang goat  Qianbei ma goat  Nubian goat  
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