苎麻expansin家族成员鉴定与表达分析

苎麻是一种重要的纤维作物，纤维被用作纺织工业的原料。扩展蛋白具有诱导依赖pH的细胞壁伸长和压力松弛的特性。为了对苎麻基因组中expansin家族成员数量和类型进行鉴定，并研究在纤维细度不同的苎麻茎皮中扩展蛋白基因的表达情况，研究首先在苎麻中苎1号基因组数据库挖掘到24个扩展蛋白基因家族成员，通过生物信息学方法对其分子量、等电点、信号肽、亚细胞定位、motif及基因结构进行分析和预测。系统进化树结果显示：扩展蛋白包括α亚族成员17个、β亚族4个、α类亚族1个和β类亚族2个，共分为3类；expansin家族同一进化支蛋白结构域比较保守且有一个特有的motif。然后，利用苎麻茎皮扩展蛋白基因家族成员转录组表达分析和qRT-PCR验证，发现两个基因在两个纤维细度差异显著的品种及其5个不同生长期表达量差异显著。该结果有助于了解苎麻expansin家族的进化，为影响苎麻纤维发育和纤维细度相关基因及其功能的研究奠定基础。