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Tamura模型下DNA序列点突变熵性质的研究
引用本文:郭子湖,张瑞明,袁志发. Tamura模型下DNA序列点突变熵性质的研究[J]. 西北农林科技大学学报(自然科学版), 2013, 41(2): 189-194
作者姓名:郭子湖  张瑞明  袁志发
作者单位:西北农林科技大学 理学院 应用数学研究所;西北农林科技大学 理学院 应用数学研究所;西北农林科技大学 理学院 应用数学研究所
基金项目:西北农林科技大学引进人才科研启动费项目(Z11021105)
摘    要:【目的】研究在较复杂的核苷酸替换模型,即Tamura模型下DNA序列中4种核苷酸频率随世代变化的规律,以得到序列熵的性质,为了解生物进化机理奠定基础。【方法】在Shannon信息熵理论基础上,利用La-grange乘数法进行理论证明,并用Mathematica软件模拟了Tamura模型下DNA序列中4种核苷酸组成的变化规律和序列熵的变化过程。【结果】DNA序列在Tamura模型下发生突变,各核苷酸频率随世代变化逐渐趋于平衡,且序列熵趋于最大值。【结论】核苷酸突变具有保熵性,验证了前人生物是朝着多样性增大的方向发展进化的结论。

关 键 词:生物多样性  Shannon信息熵  核苷酸替换  Tamura模型
收稿时间:2012-06-15

Entropy properties of the point mutations in DNA sequence using Tamura model
GUO Zi-hu,ZHANG Rui-ming,YUAN Zhi-fa. Entropy properties of the point mutations in DNA sequence using Tamura model[J]. Journal of Northwest A&F University(Natural Science Edition), 2013, 41(2): 189-194
Authors:GUO Zi-hu  ZHANG Rui-ming  YUAN Zhi-fa
Affiliation:(Institute of Applied Mathematics,College of Science,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China)
Abstract:
Keywords:biodiversity  Shannon entropy  nucleotide substitution  Tamura model
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