| 橡胶树EST-SSRs发掘研究 |
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| 引用本文： | 华玉伟,卢轶,龙青姨,曾霞,胡彦师,黄华孙. 橡胶树EST-SSRs发掘研究[J]. 热带作物学报, 2008, 29(5): 583-588 |
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| 作者姓名： | 华玉伟 卢轶 龙青姨 曾霞 胡彦师 黄华孙 |
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| 作者单位： | 中国热带农业科学院橡胶研究所,国家橡胶树育种中心,农业部热带作物栽培生理学重点开放实验室海南,儋州,571737 |
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| 基金项目： | 国家自然科技资源平台项目 ， 国家科技支撑计划项日 |
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| 摘 要： | 随着橡胶树大量ESTs序列的产生,为EST-SSRs发掘提供了丰富的公共序列资源.本研究首先将11 809条橡胶树ESTs组装成3 932条非冗余序列,其中323条ESTs检索到SSRs 358个,SSRs出现的频率为9.1%.SSR重复单元共93种.其中二核苷酸重复(57.5%)、三核苷酸重复(26.0%)和六核苷酸重复(12.8%)占所有重复单元的96.3%.对323条SSR-ESTs进行特异扩增弓l物设计,共获得158对引物,对48份包括31份魏可汉种质、12份1981'野生种质、2份色宝橡胶、2份光亮橡胶和l份少花橡胶扩增,其中60对引物扩增出l条预期长度DNA片段,占所有设计引物的38%,并筛选到40对具有多态性的引物.EST-SSRs标记的发掘为巴西橡胶树分子辅助育种、种质资源功能遗传多样性分析等研究提供了良好的标记.
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| 关 键 词： | 橡胶树 分子标记 |
Development of EST-SSRs Using Public ESTs in Hevea |
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| Hua Yuwei,Lu Yi,Long Qingyi,Zeng Xi,Hu Yanshi and Huang Huasun. Development of EST-SSRs Using Public ESTs in Hevea[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2008, 29(5): 583-588 |
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| Authors: | Hua Yuwei Lu Yi Long Qingyi Zeng Xi Hu Yanshi Huang Huasun |
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| Affiliation: | Rubber Research Institute CATAS/Ministry of Agriculture Key Laboratory for Tropical Crop Physiology/State Key Center for Rubber Breeding;Rubber Research Institute CATAS/Ministry of Agriculture Key Laboratory for Tropical Crop Physiology/State Key Center for Rubber Breeding;Rubber Research Institute CATAS/Ministry of Agriculture Key Laboratory for Tropical Crop Physiology/State Key Center for Rubber Breeding;Rubber Research Institute CATAS/Ministry of Agriculture Key Laboratory for Tropical Crop Physiology/State Key Center for Rubber Breeding;Rubber Research Institute CATAS/Ministry of Agriculture Key Laboratory for Tropical Crop Physiology/State Key Center for Rubber Breeding;Rubber Research Institute CATAS/Ministry of Agriculture Key Laboratory for Tropical Crop Physiology/State Key Center for Rubber Breeding |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Esrr-SSRs |
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