| 摘 要： | [目的]研究非洲猪瘟病毒（African swine fever virus,ASFV）pI215L蛋白的结构与功能。[方法]从ASFV数据库（The African Swine Fever Virus Database,ASFVdb）下载29个不同ASFV毒株的pI215L基因序列，利用生物信息学工具分析不同毒株pI215L基因的同源性及遗传进化关系，预测pI215L蛋白的理化性质、二级结构、线性表位及三维空间位置。[结果]不同ASFV毒株的pI215L基因核苷酸序列同源性较高；pI215L蛋白性质不稳定，亲水性较高，二级结构主要含有α-螺旋、延伸链、β-转角、无规卷曲4种形式，含有1个E2泛素化结合酶结构域；共有16处肽段是潜在的线性表位；使用SWISSMODEL对pI215L蛋白的三级结构完成同源建模，在PDB数据库中与6NYO.1 (ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2和ubiquitin)的同源性达46.06%；再使用PyMOL软件对pI215L蛋白进行构象表位预测，准确定位预测的表位三维空间位置在模型中的分布。[结论]该研究结果为解析pI21...
|
