以湖南和湖北大豆[Glycine max(L.)Merr.]为例分析影响遗传多样性评价的因素 |
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作者姓名: | 关媛 鄂文弟 王丽侠 关荣霞 刘章雄 常汝镇 曲延英 邱丽娟 |
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作者单位: | 中国农业科学院作物科学研究所,国家农作物基因资源与遗传改良重大科学工程/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室,北京 100081;新疆农业大学,新疆乌鲁木齐 830052;东北农业大学,教育部大豆生物学重点实验室,黑龙江哈尔滨 150030 |
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摘 要: | 以不同来源大豆种质为材料进行基因组SSR分析,探讨大豆遗传多样性研究方法,旨在为科学评价大豆种质资源提供参考。当取样比例相同时,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆,但两省大豆遗传多样性指数之间没有显著差异。当取样量相同时,利用随机取样法比较,湖南大豆的遗传多样性显著高于湖北,而利用聚类取样比较,两省大豆的遗传多样性没有显著差异。在遗传多样性指数相同情况下,湖北大豆的遗传丰富度显著高于湖南大豆。取样数与三个遗传多样性评价参数(等位变异数、Shannon指数、He)之间均达到显著和极显著相关。以湖南大豆为例,估算出在大豆SSR遗传多样性分析中,至少需要50~60个样本,即占总体9.0%~10.8%的取样比例,才能代表总体的遗传变异。提出在评价大豆遗传多样性时,应用大豆样本数对其遗传多样性指数计算公式进行修正,建议将Shannon指数计算公式改为H=-lnN ∑Pi lnPi (N为样本数)。根据修正公式分析,结果表明,湖北大豆的遗传多样性高于湖南大豆。
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关 键 词: | 大豆 遗传多样性 SSR标记 Shannon指数 期望杂合度 等位变异数 取样量 |
收稿时间: | 2006-01-26 |
修稿时间: | 1900-01-01 |
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