凝结芽孢杆菌对蛋雏鸡肠道菌群结构的影响

【目的】分析凝结芽孢杆菌蛋雏鸡肠道菌群的变化。【方法】选取1日龄蛋雏鸡288只，分为对照组和凝结芽孢杆菌组，每组72只。饲养28 d后，每组选取6只蛋雏鸡，收集盲肠内容物，提取样品DNA,采用MiSeq PE300高通量测序平台进行测序分析。【结果】共获得121.8万条高质量序列，基于相似度大于97%的原则聚类后共获得1 926个OTU(Operational Taxonomic Unit)。与对照组相比，凝结芽孢杆菌低剂量组、凝结芽孢杆菌中剂量组和凝结芽孢杆菌高剂量组的4种α多样性指数存在差异显著(P<0.05)。在属水平上，添加凝结芽孢杆菌低剂量组、凝结芽孢杆菌中剂量组和凝结芽孢杆菌高剂量组的另枝菌属、毛螺菌属和巴恩斯氏菌属相对丰度均显著高于对照组(P<0.05),而拟杆菌属、布劳特氏菌属、梭菌属和乳杆菌属的相对丰度均显著低于对照组(P<0.05)。凝结芽孢杆菌高剂量组与相应的对照组相比，有1个菌目、6个菌科和18个菌属有显著差异。差异菌群的功能主要集中在氨基酸运输与代谢、碳水化合物运输与代谢及能量的产生和转换等相关基因上。凝结芽孢杆菌高剂量组与对照组相比差异显著...