| 甜瓜果斑病致病基因生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 毛云,苏小龙,宁雪飞,李冠. 甜瓜果斑病致病基因生物信息学分析[J]. 北方园艺, 2017, 0(2). DOI: 10.11937/bfyy.201702026 |
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| 作者姓名： | 毛云 苏小龙 宁雪飞 李冠 |
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| 作者单位： | 新疆大学生命科学与技术学院,新疆乌鲁木齐,830046;新疆大学生命科学与技术学院,新疆乌鲁木齐,830046;新疆大学生命科学与技术学院,新疆乌鲁木齐,830046;新疆大学生命科学与技术学院,新疆乌鲁木齐,830046 |
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| 摘 要： | 以已报道的甜瓜果斑病的致病基因和多个与致病性相关的未知蛋白为试材,采用生物信息学方法研究了其致病基因,并且利用生物信息学的工具和软件分析这些未知蛋白,以期为今后从分子水平防治果斑病奠定理论基础。结果表明:通过DNAMAN软件的比对分析,得到3个综合匹配程度较高的未知蛋白,预测这些蛋白是由该病菌Ⅲ型分泌系统的hrp基因簇编码;通过Bioedit和ProtParam软件工具分析获得6个未知蛋白的氨基酸组成、大小、分子质量、理论等电点和疏水性;同时运用DNAMAN软件分析得到相对应的二级结构。该研究结果可为今后深入研究此类基因提供指导作用。
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| 关 键 词： | 甜瓜 果斑病 致病基因 生物信息学 |
Bioinformatic Analysis of the Pathogenic Genes in Acidovorax citrulli |
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| MAO Yun,SU Xiaolong,NING Xuefei,LI Guan. Bioinformatic Analysis of the Pathogenic Genes in Acidovorax citrulli[J]. Northern Horticulture, 2017, 0(2). DOI: 10.11937/bfyy.201702026 |
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| Authors: | MAO Yun SU Xiaolong NING Xuefei LI Guan |
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