人参皂苷生物合成相关基因PgRg2BBE克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 李傲,刘思章,王义,王康宇,朱蕾,李俐,姜悦,王艳芳.人参皂苷生物合成相关基因PgRg2BBE克隆及生物信息学分析[J].吉林农业大学学报,2023(6):693-701. |
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作者姓名: | 李傲 刘思章 王义 王康宇 朱蕾 李俐 姜悦 王艳芳 |
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作者单位: | 1. 吉林农业大学生命科学学院,吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心;2. 吉林农业大学国家中医药管理局药用植物栽培育种三级实验室 |
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基金项目: | 吉林省科技发展计划项目(20180101027JC,20200403011SF,20210204063YY);;吉林省教育厅“十三五”科学技术项目(JJKH20170310KJ);;国家自然科学基金青年基金项目(31401445); |
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摘 要: | 克隆与人参皂苷Rg2合成相关的重要酶基因PgRg2BBE全长cDNA序列,并利用在线软件对该基因编码的蛋白质进行理化性质、结构域、亚细胞定位和系统进化等分析。结果表明:PgRg2BBE基因cDNA序列长为1 638 bp,编码545个氨基酸。PgRg2BBE蛋白分子量为60 967.10 u,等电点为8.88,不稳定性指数为34.04,预测该蛋白为一种稳定的亲水性跨膜蛋白,主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。PgRg2BBE蛋白含有FAD_binding_4和BBE功能结构域,定位于叶绿体中,含有24个氨基酸序列信号肽。系统发育树分析发现,其与智利茄的亲缘关系最近,氨基酸序列多重比对发现,RgRg2BBE中含有4个保守基序,进一步与拟南芥AtBBE家族蛋白进行同源序列比对,发现它们同时具有4个保守基序(RKYGL、MGED、FWAIRGG、FPEI)。
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关 键 词: | 人参皂苷Rg2 生物合成 PgRg2BBE 基因克隆 生物信息学 序列分析 |
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