利用转录组挖掘羊肚菌继代菌丝退化相关基因的初步探讨

继代培养7代羊肚菌（Morchellaesculenta）菌丝体，计算不同代数的菌丝生长速度，再分别收集第一代（M 1）和第六代（M 6）菌丝体，通过转录组测序，GO功能注释和富集与KEGG通路富集，得到关键差异基因，最后选取7个与退化相关的关键差异基因cel1、lac2、cah、png1、zpr1、did2和Hsp31，采用荧光定量PCR测定基因相对表达量，以验证转录组分析结果的可靠性。结果表明：当继代培养至第7代时，羊肚菌菌丝不能生长；M 6与M 1相比，共得到575个关键差异基因，其中表达上调198个，表达下调377个；GO富集表明，关键差异基因主要富集在活性氮代谢过程、硝酸盐代谢过程、硝酸盐同化和从头合成次黄嘌呤核苷酸的生物过程；KEGG通路富集表明，关键差异基因主要富集在磷酸戊糖途径、泛酸和乙酰辅酶A生物合成、硒化合物代谢、生物素代谢和精氨酸生物合成通路；7个关键差异基因的相对表达量与转录组测序分析结果一致。