5株湖南猪圆环病毒1型全基因组测序与遗传进化分析

为了解湖南猪群猪圆环病毒1型（PCV1）的遗传变异情况，以PCV1阳性DNA为模板，使用PCR方法分两段扩增PCV1全基因序列并进行拼接。结果共获得5个PCV1全基因组，其中3株全基因大小为1 759 bp，另外2株分别为1 758 bp和1 760 bp。5株全基因组同源性为98.4%~99.7%，与国内外的PCV1全基因组同源性为98.1%~99.7%；ORF2序列同源性为97.6%~99.6%，与国内外的PCV1 ORF2同源性为96.1%~99.9%。系统发育树显示，5株PCV1均属于同一分支，并显示出一定的地理差异，但差异较小。结果表明，湖南省流行的PCV1毒株基因较为稳定，分离株间差异较小。本研究为湖南省猪圆环病毒病防控及相关研究奠定了基础。

Whole Genome Sequencing of Five Strains of PCV1 in Hunan Province and Analysis on Their Genetic Evolution