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| S VA及α-干扰素对P K-15细胞microRNA转录谱影响的分析 | |
| 作者姓名： | 王晨 罗愿 陈彦希 彭远义 周远成 徐志文 刘骁 |
| 作者单位： | 1. 西南大学动物医学院;2. 四川省畜牧科学研究院;3. 四川农业大学动物医学院 |
| 基金项目： | 中央高校基本科研业务费专项资金重点项目(XDJK2019B045); |
| 摘 要： | 为探究猪塞内卡病毒A(SVA)感染、干扰素(IFN-α)处理对猪肾细胞(PK-15)微RNA(microRNA,miRNA)转录谱的影响,本研究分别构建SVA感染的PK-15(PK-15/SVA)、IFN-α处理的PK-15 (PK-15/IFN),SVA感染再经IFN-α处理的PK-15细胞(PK-15/SVA/IFN),通过荧光定量PCR(qPCR)分别检测各组细胞中SVA VP1及IFN-αm RNA的转录水平。结果显示,与PK-15相比,PK-15/SVA及PK-15/SVA/IFN细胞中SVA VP1基因的转录水平极显著升高(P<0.001),PK-15/SVA/IFN中IFN-α的转录水平显著或极显著升高(P<0.05、P<0.01)。通过转录组测序技术(RNA-Seq)分析各组细胞mi RNA的转录谱,采用Spss软件统计各组细胞中转录差异miRNA的数量;利用基于负二项分布的DESeq2筛选各组细胞中转录显著差异mi RNA;采用miRanda、PITA和RNAhybrid 3个软件预测各组细胞转录显著差异miRNA的靶基因,通过miREvo和mird... |
| 关 键 词： | 塞内卡病毒A α-干扰素 microRNA 转录差异 |