蓝莓VcILR1基因的克隆与表达分析 |
| |
引用本文: | 胡丽超,王小敏,王鑫,吴雅琼,吴文龙,闾连飞,李维林.蓝莓VcILR1基因的克隆与表达分析[J].福建农业学报,2023(2):151-157. |
| |
作者姓名: | 胡丽超 王小敏 王鑫 吴雅琼 吴文龙 闾连飞 李维林 |
| |
作者单位: | 1. 南京林业大学南方现代林业协同创新中心/南京林业大学林学院;2. 江苏省中国科学院植物研究所(南京中山植物园)/江苏省植物资源研究与利用重点实验室;3. 江苏省兴化市林业技术指导站 |
| |
摘 要: | 【目的】克隆蓝莓(Vaccinium spp)生长素酰胺水解酶基因VcILR1,分析该基因在蓝莓花、叶、茎、果和根中的表达模式和经过赤霉素处理的青果和成熟果两个时期的表达情况,为进一步探究该基因功能和蓝莓胚珠败育的机制提供依据。【方法】以蓝莓果实的cDNA为模板克隆得到VcILR1基因,利用ProtParam等工具对VcILR1进行生物信息学分析,利用qRT-PCR方法对VcILR1基因在蓝莓不同组织及赤霉素处理的青果和成熟果中的表达量进行分析。【结果】成功克隆到蓝莓VcILR1基因,该基因含976 bp的开放阅读框(ORF),编码325个氨基酸,有两个保守结构域,分别是Peptidase_M20和M20_dimer;编码蛋白的分子质量35 364.20 kDa,理论等电点5.67,不稳定系数43.57,脂肪系数88.55,亲水性平均值-0.054,属于不稳定亲水性蛋白。系统进化树分析表明蓝莓VcILR1基因与山茶科植物的茶树(Camellia sinensis)生长素酰胺水解酶(IAA-Leucine Resistant 1-like,ILL)基因亲缘关系较近。qRTPCR分析结果显...
|
关 键 词: | 蓝莓 VcILR1基因 基因克隆 无籽 |
|
|