| 菜蝽线粒体基因组密码子偏好性分析 |
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| 引用本文： | 赵婉清,张敏,柳大军,雷慧,伊文博,刘佳,高志忠,张虎芳.菜蝽线粒体基因组密码子偏好性分析[J].山西农业科学,2020,48(7). |
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| 作者姓名： | 赵婉清 张敏 柳大军 雷慧 伊文博 刘佳 高志忠 张虎芳 |
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| 作者单位： | 忻州师范学院生物系,山西忻州034000;忻州师范学院生物系,山西忻州034000;忻州师范学院生物系,山西忻州034000;忻州师范学院生物系,山西忻州034000;忻州师范学院生物系,山西忻州034000;忻州师范学院生物系,山西忻州034000;忻州师范学院生物系,山西忻州034000;忻州师范学院生物系,山西忻州034000 |
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| 基金项目： | 山西省高等学校科技创新项目;忻州师范学院院级科研基金资助项目 |
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| 摘 要： | 目前,大量昆虫线粒体基因组已被测出,关于昆虫线粒体基因组密码子偏好性的研究也逐渐展开。通过对菜蝽线粒体基因组中的蛋白编码基因组密码子偏好性进行分析,旨在为研究该类群的进化提供相应的理论依据。采用Codon W、CAIcal统计了13条蛋白编码基因序列密码子各位点的GC含量和有效密码子数(ENC);采用MEGA计算同义密码子使用频率(RSCU);利用中性绘图和ENC绘图分析密码子偏好性成因。结果显示,密码子第3位的GC含量明显小于第1、2位,且偏好使用第3位为A/U结尾的密码子;中性绘图和ENC绘图分析结果表明,选择压力是影响菜蝽线粒体蛋白编码基因组密码子偏好性的主要原因。
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| 关 键 词： | 菜蝽 线粒体 密码子偏好性 最优密码子 |
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