中国番茄黄化曲叶病毒卫星DNAβ在心叶烟中的遗传结构及种群变异

为明确中国番茄黄化曲叶病毒(Tomato yellow leaf curl China virus,TYLCCNV)伴随的卫星DNAβ分子在寄主体内的遗传结构特点及种群变异水平,将TYLCCNV分离物Y10(Y10)和伴随的DNAβ(Y10β)的全长侵染性克隆经农杆菌介导共同接种心叶烟,从Y10β的分子克隆出发,对心叶烟中Y10β的种群结构、变异水平、突变分布及碱基变异类型进行分析。结果表明,Y10β种群具有丰富的遗传多样性及较高的变异水平,所获得的43个Y10β全长克隆在核苷酸水平均发生不同程度的变异,接种后60天的Y10β种群60-1和种群60-2的突变频率分别为2.7×10-3和3.0×10-3,另一个接种后120天的种群120-1的突变频率为3.0×10-3;此卫星DNAβ的变异位点在整个基因组内均有分布,但在A-rich区碱基变异位点数最多,且主要为碱基A的缺失和插入,特别是在889～901核苷酸位点,所得43个克隆中有19个克隆在这一区段发生碱基A的缺失或插入;此外,Y10β的碱基替换突变类型以A突变为G及T突变为C的比例较高。