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贵州辣椒脉斑驳病毒的检测及株系分化研究
引用本文:王莉爽,陈小均,何海永,谭清群,陈文,黄露,杨学辉.贵州辣椒脉斑驳病毒的检测及株系分化研究[J].南方农业学报,2017,48(7):1220-1224.
作者姓名:王莉爽  陈小均  何海永  谭清群  陈文  黄露  杨学辉
作者单位:贵州省植物保护研究所,贵阳,550006
基金项目:公益性行业(农业)科研专项项目,贵州省农业科学院自主创新科研专项项目
摘    要:目的]明确贵州辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,ChiVMV)的分布和遗传进化情况,为该病毒的基因功能及其与宿主植物互作关系研究提供科学依据.方法]采用反转录PCR(RT-PCR)对采自贵州贵阳、遵义、黔西和大方的疑似ChiVMV辣椒样品进行扩增并测序;运用DNAMAN和MEGA对ChiVMV CP基因和和3'-UTR进行序列拼接及分析,并构建系统发育进化树.结果]从39份疑似ChiVMV辣椒样品中检测出7份阳性样品,检出率为17.95%.将贵州ChiVMV株系的部分CP基因和3'-UTR序列在NCBI中进行核苷酸序列比对,发现其与来源于四川辣椒上的ChiVMV株系的同源性最高,为99%,与我国其他省份ChiVMV株系同源性大于90%;构建的系统发育进化树表明贵州株系与四川和云南株系亲缘关系最近.结论]贵州ChiVMV株系存在明显的株系分化现象.

关 键 词:辣椒    辣椒脉斑驳病毒    株系分化    贵州

Detection of Chilli veinal mottle virus from Guizhou and its strain differentiation
WANG Li-shuang,CHEN Xiao-jun,HE Hai-yong,TAN Qing-qun,CHEN Wen,HUANG Lu,YANG Xue-hui.Detection of Chilli veinal mottle virus from Guizhou and its strain differentiation[J].Journal of Southern Agriculture,2017,48(7):1220-1224.
Authors:WANG Li-shuang  CHEN Xiao-jun  HE Hai-yong  TAN Qing-qun  CHEN Wen  HUANG Lu  YANG Xue-hui
Abstract:
Keywords:pepper  Chilli veinal mottle virus  strain differentiation  Guizhou
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