广西巴马小型猪PPARγ基因克隆及组织表达差异分析 |
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引用本文: | 申玉建,方程,邱庆庆,司景磊,吴延军,杨祝良,杨秀荣,郭亚芬,蒋和生.广西巴马小型猪PPARγ基因克隆及组织表达差异分析[J].南方农业学报,2017,48(10):1884-1890. |
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作者姓名: | 申玉建 方程 邱庆庆 司景磊 吴延军 杨祝良 杨秀荣 郭亚芬 蒋和生 |
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作者单位: | 广西大学 动物科学技术学院,南宁,530004 |
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基金项目: | 国家现代农业产业技术体系广西生猪创新团队建设项目,广西家畜遗传育种改良重点实验室开放项目 |
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摘 要: | 目的]克隆广西巴马小型猪过氧化物酶增殖物激活受体γ基因(PPARγ),并确定其在不同组织中的表达情况,为后续研究该基因在猪支原体肺炎(MPS)中的作用机制打下基础.方法]利用RT-PCR克隆广西巴马小型猪PPARγ基因,并进行BLAST比对分析及其推导蛋白的生物信息学分析;以实时荧光定量PCR检测PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪心脏、脾脏、肺脏、肾脏、大肠、小肠、肌肉和脂肪中的表达情况.结果]广西巴马小型猪PPARγ基因开放阅读框序列1515 bp,编码504个氨基酸.广西巴马小型猪PPARγ基因推导氨基酸序列与GenBank已发表的猪PPARγ基因(FJ436399.1)推导氨基酸序列同源性最高,达100.0%;而与牛(NM_181024.2)、人类(NM_005037.5)、猕猴(NM_001032860.1)、鼠(NM_001308354.1)和鸿雁(KJ019822.1)的同源性分别为92.9%、91.8%、91.5%、90.5%和83.5%,表明PPARγ基因高度保守.PPARγ蛋白分子量为57380.91 Da,理论等电点(pI)为6.88,不稳定系数49.26,脂肪指数为88.21,亲水性平均水平为-0.293,为亲水性蛋白,其二级结构主要是α-螺旋,占总数的39.09%.PPARγ基因在广西巴马小型猪大肠组织中的表达量最高,极显著高于其他组织(P<0.01),而在肾脏、心脏和肌肉组织中的表达量极低.结论]PPARγ基因在18月龄广西巴马小型猪的各组织中均有表达,但不同组织中的表达水平存在明显差异,可能与其在不同组织中的功能差异有关.
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关 键 词: | 广西巴马小型猪 PPARγ基因 猪肺炎支原体 克隆 组织表达差异 炎症调控 |
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