1株猪繁殖与呼吸综合征病毒云南株的遗传演化分析 |
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引用本文: | 王海燕,吕磊,徐向明,崔盟,迟兰,刘文博.1株猪繁殖与呼吸综合征病毒云南株的遗传演化分析[J].江苏农业科学,2010(6). |
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作者姓名: | 王海燕 吕磊 徐向明 崔盟 迟兰 刘文博 |
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基金项目: | 江苏省畜牧兽医职业技术学院博士启动基金,扬州大学教改课题 |
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摘 要: | 将2008年云南某猪场送检的疑似猪繁殖与呼吸综合征病例的病料处理后,接种Marc-145细胞,并对其进行病毒分离和鉴定,将分离株命名为Yunnan-08株.根据GenBank中PRRSV的基因序列进行设计.合成了针对ORF5和ORF7基因的引物,将RT-PCR扩增目的基因克隆入pGEM-Teasy载体中进行测序,再将测序结果提交给GenBank.应用DNAstar软件包分析,将该毒株的ORF5和ORF7基因序列及其推断氨基酸序列分别与PRRSV欧洲型代表株Lv、美洲型代表株VR2332和中国参考株CH-1a(AY032626)等毒株相应基因序列进行核苷酸比对,并与ATCC-VR2332(U87392)株、Lv(M96262)株等毒株进行氨基酸同源性比较,绘制系统的进化树,确定遗传演化关系.结果表明,该分离株的ORF7与VR2332的ORF7基因同源性为56.9%,与Lv株的ORF7基因同源性为41.7%;该分离株的ORF5与VR2332的ORF5基因同源性为87.1%,与Lv株的ORF5基因同源性为63.8%.表明新分离到的PRRSV Yunnan-08株仍属北美型,但存在很大变异,该分离株的ORF5与中国标准株CH-1a的ORF5基因同源性为93.4%,而ORF7与中国标准株CH-1a的ORF7基因同源性仅为56.6%.同一个毒株不同的开放阅读框架遗传演化的差异如此之大,这在以往未见报道,该病毒的变异为我国对该病的防控设置了障碍,毒株遗传监测显得十分重要.
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关 键 词: | 猪繁殖与呼吸综合征病毒 病毒分离 遗传发生分析 ORF5 ORF7 |
Phylogenetic analysis of a porcine reproductive and respiratory syndrome virus strain isolated from Yunnan Province |
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Abstract: | |
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