| 猪Musclin基因编码蛋白的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 孙超,王力,齐仁立,姜东凤.猪Musclin基因编码蛋白的生物信息学分析[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2010,38(1):30-34. |
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| 作者姓名： | 孙超 王力 齐仁立 姜东凤 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学动物科技学院; |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(30871785); 教育部重点项目(105167); 教育部新世纪优秀人才计划项目(NCET-06-0865); 国家“十一五”科技支撑计划项目(2006BAD04A11) |
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| 摘 要： | 【目的】克隆猪Musclin基因,分析和预测其编码蛋白的结构与功能。【方法】从猪肌肉组织中提取总RNA,RT-PCR扩增获得Musclin基因,对其进行克隆和测序,并根据生物信息学分析方法,利用Tmpred、SignalP3.0、TargetP 1.1等分析软件,对猪Musclin蛋白的跨膜结构、信号肽、细胞定位、结构特征等进行分析和预测。【结果】猪Musclin蛋白主要集中在分泌途径上,存在于细胞外,其核苷酸序列与家兔的具有较高的相似性,氨基酸序列32～45位和55～63位存在2个可能的强跨膜螺旋区,该蛋白的空间结构以α螺旋、β转角和无规则卷曲为主;其1～26位氨基酸序列是一段信号肽,在26与27位氨基酸之间存在1个酶切位点;其羧基端含有较多的转角结构,同时该区域的抗原指数较高,亲水性指数和呈现在蛋白表面的可能性均较大。【结论】Musclin是一种含有信号肽序列的跨膜蛋白。
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| 关 键 词： | Musclin 生物信息学 结构与功能 序列分析 |
| 收稿时间： | 2009/4/22 0:00:00 |
Analysis of the structure and function of porcine Musclin protein by bioinformatics |
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| SUN Chao,WANG Li,QI Ren-li and JIANG Dong-feng.Analysis of the structure and function of porcine Musclin protein by bioinformatics[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2010,38(1):30-34. |
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| Authors: | SUN Chao WANG Li QI Ren-li and JIANG Dong-feng |
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| Institution: | SUN Chao,WANG Li,QI Ren-li,JIANG Dong-feng(College of Animal Science , Technology,Northwest A&F University,Yangling,Shaanxi 712100,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Musclin bioinformatic structure and function sequence analysis |
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