基于2b-RAD技术分析白化茶树品种(系)遗传多样性 |
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作者姓名: | 刘声传 许应芬 魏杰 鄢东海 陈智雄 徐霖 刘燕 周玉锋 |
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作者单位: | 1.贵阳学院生物与环境工程学院,贵阳 550005;2.贵州省农业科学院茶叶研究所,贵阳 550006 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31760227);贵州省农业科技支撑计划项目(黔科合支撑〔2018〕2254);贵州省教育厅青年科技人才成长项目(黔教合KY字〔2019〕097);贵阳学院博士科研启动基金项目(0203033003014) |
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摘 要: | 为揭示白化茶树品种(系)的遗传多样性,利用简化基因组测序技术(2b-restriction site-associated DNA,2b-RAD)对23份茶树种质(20份白化,3份常绿对照)进行测序,分析其遗传多样性、亲缘关系和群体结构。结果表明,共获得576 193 750条高质量测序数据和56 498个高质量SNPs。系统发育树和主成分分析表明,23份种质可分为3个类群,类群Ⅰ为1份来自贵州的大叶种,类群Ⅱ包含来自贵州的地方种质6份,类群Ⅲ包含来自浙江的14份种质和来自安徽、福建的2份种质。基于系统发育树,3个类群的遗传多样性参数均表现为:类群Ⅰ>类群Ⅱ>类群Ⅲ,类群Ⅰ和类群Ⅱ、类群Ⅲ之间分别呈现中、高度的遗传分化水平。综上所述,白化茶树品种(系)存在中、高度的遗传分化,不同地理来源的种质间遗传分化更大,为白化茶树种质鉴定、资源利用和育种等提供了理论依据。
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关 键 词: | 白化茶树 2b-RAD SNP 遗传多样性 |
收稿时间: | 2021-07-28 |
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