美伐他汀产生菌桔青霉表观遗传调控基因RpdA的克隆及生物信息学解析 |
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引用本文: | 宋璨,周峰,胡昌华. 美伐他汀产生菌桔青霉表观遗传调控基因RpdA的克隆及生物信息学解析[J]. 西南大学学报, 2013, 35(6) |
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作者姓名: | 宋璨 周峰 胡昌华 |
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作者单位: | 西南大学药学院现代生物医药研究所,重庆,400715 |
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基金项目: | 重庆市科技攻关重点项目 |
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摘 要: | 为从表现遗传调控的角度对美伐他汀产生菌桔青霉进行分子操作和遗传育种,克隆桔青霉表观遗传调控基因组蛋白去乙酰化酶基因RpdA,对多种真菌的组蛋白去乙酰化酶编码基因序列比较分析,设计简并引物,以桔青霉cDNA和DNA为模板,结合3'-race技术,克隆获取RpdA基因的全长序列,并对其蛋白结构进行生物信息学分析.研究发现:RpdA基因长2 072 bp(GenBank登录号:KC417298),含4个外显子和3个内合子,cDNA开放阅读框长为1 092 bp(GenBank登录号:KC417296),编码639个氨基酸,蛋白结构显示了较为保守的组蛋白去乙酰化酶ClassI家族结构特征.
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关 键 词: | 表现遗传 组蛋白去乙酰化酶 基因克隆 桔青霉 |
Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of the Epigenetic Regulation Gene RpdA in the Mevastatin-Producing Fungus Penicillium citrinum |
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Abstract: | |
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Keywords: | epigenetic regulation histone deacetylase (HDAC) gene cloning Penicillium citrinum |
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