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藏东南地区毛壳属真菌多样性及系统发育分析
摘    要:为分析藏东南地区毛壳属(Chaetomium Kunze)真菌多样性及系统发育情况,从藏东南5个市、县采集土壤、植物残体和动物粪便等标本共355份,采用组织分离法和稀释分离法得到36株毛壳菌,平均分离几率为10.14%。将分离得到的菌株进行多样性指数特征分析,并按形态特征初步分类;运用聚合酶链式反应对菌株的rDNA-ITS和β-tubulin基因序列进行扩增与序列测定;利用MEGA 5.0软件构建rDNA-ITS和β-tubulin基因系统发育进化树。结果显示:林芝县的毛壳属真菌多样性指数最高,为1.178 5,物种均匀度指数也最高,为0.605 6;昌都市的毛壳属真菌丰富度指数最高,达到0.861 4。不同地区毛壳属真菌的优势种也存在差异:工布江达县的优势种为球毛壳(C.globosum);墨脱县和昌都市的优势种为粪生毛壳(C.funicola);察隅县的优势种为旋丝毛壳(C.bostrychodes);林芝县的优势种为反卷毛壳(C.convolutum)。根据形态特征可将36株菌归属为8个种。分析扩增后的rDNA-ITS和β-tubulin基因序列发现,β-tubulin基因的变异位点、单倍型总数、单倍型多样度、核苷酸多样性指数和核苷酸平均差异数与rDNA-ITS序列的这些参数存在显著差异,体现出更大的碱基变异性。系统发育进化树表明,供试的36个菌株被分为7个组,rDNA-ITS和β-tubulin这2个基因片段不仅可用来区分毛壳菌属中形态差异较大的种,如印度毛壳(C.indicum)、大果毛壳(C.megalocarpum)、球毛壳(C.globosum)、粪生毛壳(C.funicola),还可区分形态特征非常相似的印度毛壳(C.indicum)和直立毛壳(C.erectum),同时也可以对一些形态上难以鉴定的种进行初步鉴定,但不能较好地区分反卷毛壳(C.convolutum)、旋丝毛壳(C.bostrychodes)和黑毛壳(C.nigricolor),需要结合更多的基因片段进行区分。综上所述,本文对藏东南地区毛壳属真菌多样性与系统发育情况进行了研究,为丰富西藏毛壳属真菌资源和开发毛壳菌代谢产物奠定了理论基础。

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