甘蓝型油菜BnFAD2-C1基因全长序列的克隆、表达及转录调控元件分析 |
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引用本文: | 刘芳,刘睿洋,彭烨,官春云.甘蓝型油菜BnFAD2-C1基因全长序列的克隆、表达及转录调控元件分析[J].作物学报,2015,41(11):1663-1670. |
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作者姓名: | 刘芳 刘睿洋 彭烨 官春云 |
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作者单位: | 湖南农业大学农学院 / 国家油料改良中心湖南分中心, 湖南长沙 410128 |
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基金项目: | 本研究由湖南省科技创新基金项目(CX2013A012)和湖南省科技重大专项(2014FJ1006)资助。 |
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摘 要: | 脂肪酸去饱和酶基因(FAD2)是控制植物体中油酸含量的关键基因,在甘蓝型油菜中有4个FAD2基因的拷贝,分别定位在A1、C1、A5、C5染色体上。本文克隆了1个FAD2拷贝基因,依据油菜基因组数据库信息,将其定位到C1染色体上,命名为Bn FAD2-C1,其开放阅读框为1155 bp。采用RACE(rapid-amplification of c DNA ends)技术获得了175 bp的5?UTR序列和212 bp的3?UTR序列。采用荧光定量PCR技术研究发现,Bn FAD2-C1在根、花和角果皮中仅保持本底水平的表达,在种子发育中期呈现高效表达,具有种子特异性诱导表达的特征。根据甘蓝和油菜基因组数据库信息,同源克隆到Bn FAD2-C1基因的启动子(promoter)和内含子(intron)序列,并通过PLACE和Plant CARE网站分析,初步预测到调控该基因转录的潜在顺式作用元件。通过茉莉酸诱导处理,Bn FAD2-C1基因表达量发生变化,推断茉莉酸在Bn FAD2-C1基因的表达过程中可能发挥一定的调控作用。
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关 键 词: | 甘蓝型油菜 BnFAD2-C1基因 RACE 生物信息学分析 茉莉酸 |
收稿时间: | 2015-04-04 |
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