| 牡蛎中细菌及其抗性基因多样性分析 |
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| 引用本文： | 谢庆超,李豪,栗瑞红,张红敏,刘海泉,潘迎捷,赵勇. 牡蛎中细菌及其抗性基因多样性分析[J]. 上海海洋大学学报, 2022, 31(5): 1260-1271 |
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| 作者姓名： | 谢庆超 李豪 栗瑞红 张红敏 刘海泉 潘迎捷 赵勇 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学食品学院;农业农村部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室上海;上海海洋大学食品质量安全检测实验室,上海海洋大学食品学院,上海海洋大学食品学院,上海海洋大学食品学院,上海海洋大学食品学院,呼和浩特市农畜产品质量安全中心,上海海洋大学食品学院;农业农村部水产品贮藏保鲜质量安全风险评估实验室上海;上海海洋大学食品质量安全检测实验室 |
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| 基金项目： | 上海市科技兴农项目(沪农科创字(2019)第3-7号);上海市优秀学术带头人(21XD1401200);上海市教育委员会科研创新计划 (2017-01-07-00-10-E00056) |
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| 摘 要： | 牡蛎作为一种滤食性双壳类海洋生物,受生活习性影响,容易富集微生物。本研究以中国四个沿海地区所产牡蛎为研究对象,分析了不同样品中微生物多样性以及肠道、腮和肌肉三种组织器官中抗生素及重金属抗性基因分布情况及分布规律,最后采用相关性分析比较了抗性基因之间的相关性。结果表明：(1)微生物含量占比前5位的细菌分别为：多形拟杆菌、芽孢杆菌、假单胞菌、河流弧菌及嗜盐杆菌斯氏弓形菌,包含了两类腐败菌属和一类致病菌属；(2)从抗性基因种类来看：氨基糖苷类ARGs检出率最高(84.1%),β-内酰胺类ARGs和喹诺酮类ARGs检出率最低(57.1%)；以牡蛎不同组织器官分析抗性基因：肌肉中检出率(65.6%)＞腮中检出率(59.1%)＞肠道中检出率(58.4%)；以不同样品来源分析抗性基因检出率：GXBH样品整体检出率最高(72.7%),SDWH1整体检出率最低(54.5%),不同来源样品在抗性基因种类及丰度上各样品差异不显著,在进行PCA分析后发现同一样品可以进行明显的归一化分类,说明同一样品不同组织器官中抗性基因关联性较大；(3)从不同抗性基因ARGs和HTGs的相关性分析来看,CARB和qnrS相关性最高,ChrR则与sulA和mecA有较大相关性,CopA与各大类ARGs都有一定相关性,说明不同类型抗性基因有存在共用一个基因盒的可能性,从对不同来源样品的相关性分析来看,基本遵循了以不同产地样品进行归一化的分类,说明养殖环境可以对牡蛎中抗性基因的分布产生影响。通过以上研究,分析了牡蛎中微生物优势菌群,初步比较了抗性基因与品种、产地、各组织器官之间的相关性,为进一步研究抗性产生机制打下了基础。
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| 关 键 词： | 牡蛎 抗性基因 多样性分析 相关性研究 |
| 收稿时间： | 2022-07-12 |
| 修稿时间： | 2022-08-29 |
Diversity analysis of bacteria and their resistance genes in oyster |
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| XIE Qingchao,LI Hao,LI Ruihong,ZHANG Hongmin,LIU Haiquan,PAN Yingjie,ZHAO Yong. Diversity analysis of bacteria and their resistance genes in oyster[J]. Journal of Shanghai Ocean University, 2022, 31(5): 1260-1271 |
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| Authors: | XIE Qingchao LI Hao LI Ruihong ZHANG Hongmin LIU Haiquan PAN Yingjie ZHAO Yong |
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| Affiliation: | College of Food Science and Technology, Shanghai Ocean University; Laboratory of Quality & Safety Risk Assessment for Aquatic Product on Storage and Preservation (Shanghai), Ministry of Agriculture and Rural Affairs;Laboratory of Food Quality and Safety Testing, Shanghai Ocean University,College of Food Science and Technology, Shanghai Ocean University,College of Food Science and Technology, Shanghai Ocean University,College of Food Science and Technology, Shanghai Ocean University,College of Food Science and Technology, Shanghai Ocean University,Hohhot Agricultural and Animal Products Quality Safety Center,College of Food Science and Technology, Shanghai Ocean University; Laboratory of Quality & Safety Risk Assessment for Aquatic Product on Storage and Preservation (Shanghai), Ministry of Agriculture and Rural Affairs;Laboratory of Food Quality and Safety Testing, Shanghai Ocean University |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | oyster resistance gene diversity analysis correlation study |
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