小菜蛾PxALP1基因的克隆与生物信息学分析

小菜蛾是一种世界性分布的重要农业害虫,也是最早对无公害生物农药Bt毒素产生抗性的种群之一。已有研究显示,在多种昆虫体内碱性磷酸酶是Bt毒素蛋白的直接受体,但在小菜蛾中,碱性磷酸酶的编码基因及其生物学功能尚极少有人研究。本研究克隆了小菜蛾PxALP1基因的开放阅读框(ORF),并推导出其氨基酸序列。经SMART网站分析,发现该蛋白质在第79~513位氨基酸残基区域存在典型的alk PPc(alkaline phosphatase homologues)结构域;经SWISS-MODEL同源模建预测蛋白质三级结构,发现该蛋白质具有典型的跨膜结构域,说明它是一个潜在的膜结合碱性磷酸酶。通过进化树分析,发现小菜蛾PxALP1与鳞翅目昆虫家蚕膜结合碱性磷酸酶的亲缘关系最近,BLAST比对发现PxALP1与家蚕Bm Alpm在氨基酸序列上的一致性(identity)为36.3%,相似性(similarity)为50.3%,说明二者之间具有较好的进化保守性。