紫花苜蓿几丁质酶ClassⅢ基因克隆及生物信息学分析 |
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引用本文: | 张文娟,李聪,王涌鑫,苗丽宏.紫花苜蓿几丁质酶ClassⅢ基因克隆及生物信息学分析[J].分子植物育种,2010,8(2):271-275. |
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作者姓名: | 张文娟 李聪 王涌鑫 苗丽宏 |
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作者单位: | 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所牧草遗传育种实验室,北京,100193 |
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基金项目: | 国家科技支撑计划,农业部苜蓿种质资源保种专项共同资助项目 |
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摘 要: | 本文根据截叶苜蓿(Medicago truc atula)几丁质酶ClassⅢ基因(GenBank:AY294484.1)的全长序列设计引物,通过RT-PCR的方法得到紫花苜蓿(Medicago sative)几丁质酶ClassⅢ的核酸序列,命名为MsChiⅢ,在NCBI中的登录号为FJ872918。利用生物信息学软件分析MsChiⅢ,预测氨基酸序列的等电点、二级结构和三级结构,并构建系统发育树。结果显示该核酸序列全长为953bp,包括完整的开放阅读框,编码301个氨基酸,等电点为8.212。该序列所编码的蛋白属于几丁质酶18家族的内切酶,分布于细胞间隙,并含有几丁质酶18家族的特征序列——LGDVDFDIE,并预测MschiⅢ可能是一种具有几丁质酶和溶菌酶的双功能酶。
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关 键 词: | 紫花苜蓿 几丁质酶 ClassⅢ基因 生物信息学 Class Ⅲ gene |
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